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AI識別出290個新蛋白質(zhì)家族

2023-09-25 16:26:52  |  來 源:科技日報  點擊:
  據(jù)瑞士巴塞爾大學(xué)官網(wǎng)20日報道,該校和瑞士生物信息學(xué)研究所(SIB)的科學(xué)家借助機器學(xué)習(xí)技術(shù),識別出了290個新的蛋白質(zhì)家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質(zhì)折疊。相關(guān)論文發(fā)表于最近的《自然》雜志。

  在過去幾年里,“阿爾法折疊”徹底改變了蛋白質(zhì)科學(xué)。這種人工智能工具利用科學(xué)家在過去50多年收集的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)進行訓(xùn)練,能夠高精度預(yù)測蛋白質(zhì)的3D形狀,去年對2.15億種蛋白質(zhì)進行了建模,幾乎可以提供任何蛋白質(zhì)形狀的信息,為科學(xué)家更好了解蛋白質(zhì)進化歷程提供了幫助,但在蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域,仍有很多秘密等待揭示。

  研究團隊此次構(gòu)建了一個由5300萬個蛋白質(zhì)組成的互動網(wǎng)絡(luò)——蛋白質(zhì)宇宙圖譜,以更好地大規(guī)模預(yù)測未知蛋白質(zhì)家族及其功能。在此基礎(chǔ)上,研究團隊識別出290個新的蛋白質(zhì)家族和一個類似花朵形狀的新蛋白質(zhì)折疊。

  研究人員指出,使用基于深度學(xué)習(xí)的工具在“蛋白質(zhì)宇宙圖譜”中尋找未知蛋白質(zhì),為生命科學(xué)的創(chuàng)新鋪平了道路。“蛋白質(zhì)宇宙圖譜”有助研究更多蛋白質(zhì),而了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能是開發(fā)新藥或通過基因編輯工具改變蛋白質(zhì)功能的第一步。